| NiNCh ( @ 2009-01-27 18:22:00 |
| Current mood: | |
| Current music: | A Perfect Circle - "Constantly consuming..." |
It's alive! (c) Robot chicken
У меня тут в лаборатории нечто вроде события, я наконец доклепал до рабочего состояния проект, который обещался сделать к ноябрю, а до этого к августу. Ну, были всякие форс-мажоры и асапы, you know. Так вот.
Под катом находится собсна творение, ну и для не больно посвящённых краткое объяснение, что это за штука.
Как уже стало очевидно, это не что иное, как неведомая ёбаная хуйня анимированный PCA с таки непойми чем. Да, мне было влом выпиливать подписи в и без того огромном коде, только на запуск которого я убил чистые сутки.
Сразу скажу, научная ценность сего действа (впрочем, как и любых других моих поползновений) откровенно невысока; если взять для аналогии вместо науки рунет, то это будет Упячка — толку мало, зато очень весело. Вообще, PCA можно применять много для чего, но вот конкретно я беру данные по SNP на выборке в пару сотен человек, и леплю приблизительно такие унылые графики (выборка людей ровно та же, можно сопоставить цвета):
Алгоритм распределяет людей по карте в зависимости от схожести их генотипов. Поскольку большинство народов мира расселялось не на дилижансах и самолётах-пароходах, а очень даже пешком и понемножку, то и географическое распределение народов уже на умозрительном уровне должно коррелировать с распределением генетическим. Последние несколько лет модно было такие штуки показывать на Европе. У нас ровно то же самое, только по Сибири; за исключением русских (в данном случае, гопники из Новосибирска и староверы из деревни образца XVI века, тоже где-то в ебенях), которые понаехали тут и место им под Владимиром, остальные же неплохо вписываются административную карту.
А причем тут анимация? Суть в том, что здесь использовался снимок не всего генома разом (в рамках доступности технологий, конечно), а серия снимков перекрывающих друг друга кусков хромосомы от начала к концу (первой и возможно ещё задело вторую, а может и нет, не проверял). Теоретически и если очень повезёт, то можно будет обнаружить такой кадр (=участок хромосомы), в котором какие-нибудь казахи уедут в дислокацию Китая, например из-за пагубного влияния Семипалатинска. Но лучше просто наблюдать, как колбасит вторую главную компоненту сверху вниз.